Amazon Genomics CLI
Procese de manera fácil y eficiente los datos sin procesar genómicos y biológicos en la nube a escala de petabytes.
Con unas pocas líneas de comandos, puede configurar motores de flujo de trabajo como Cromwell y Nextflow en AWS en cuestión de minutos sin cambiar el código existente ni modificar las herramientas de genómica de código abierto.
Automatice las tareas demandantes, como la configuración y la implementación de motores de flujo de trabajo, la creación de políticas de acceso a los datos y el ajuste de clústeres de computación para que funcionen a escala.
Ejecute flujos de trabajo de datos de genómica a mayor escala y en menos tiempo, lo que reducirá el tiempo para adquirir información útil, como la identificación de variantes y el diagnóstico de enfermedades.
El código del proyecto de la CLI de genómica de Amazon ya no se mantiene de forma activa y el repositorio de GitHub se archivará a partir del 31 de mayo de 2024. Si busca un servicio para ejecutar los flujos de trabajo de genómica, le recomendamos que explore AWS HealthOmics o que se ponga en contacto con el equipo de cuentas de AWS para obtener soluciones alternativas.
Funcionamiento
![](https://d1.awsstatic.com/product-page-diagram_Amazon-Genomics-CLI_HIW-V3.f69da41258c06a8611b1e5afeae440f63519534d.png)
Casos de uso
Medicina de precisión
Se habilita el análisis de datos de la secuenciación genómica y se utilizan los hallazgos en un entorno clínico para mejorar la salud de las personas. A nivel de la población, se identifican los grupos que son susceptibles a desarrollar un determinado problema de salud o a ser portadores durante un brote de patógenos.
Descubrimiento y desarrollo de fármacos
Se aprovecha la genética humana y el conocimiento de las funciones de los genes para permitir el desarrollo de tratamientos preventivos y el descubrimiento de fármacos nuevos.
Genómica ambiental
Se utilizan los datos de la secuenciación genómica para describir la biodiversidad, supervisar los cambios en los ecosistemas y modelar las predicciones sobre cómo responderán los organismos a nivel genético a los cambios a nivel ambiental.
Cómo comenzar
Introducción a Amazon Genomics CLI
Visite GitHub para descargar e instalar las instrucciones.
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